基本情報

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西尾 治幾

NISHIO Haruki


職名

講師

学系

データサイエンス学系

研究シーズ

統計モデリングを用いた頑健な遺伝子発現制御の解析

研究キーワード 【 表示 / 非表示

  • 花成制御

  • 植物の環境記憶

  • エピジェネティクス

  • バイオインフォマティクス

  • 時系列モデリング

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出身大学 【 表示 / 非表示

  • 神戸大学  理学部  生物学科

    大学,2010年03月,卒業,

出身大学院 【 表示 / 非表示

  • 京都大学  理学研究科  生物科学専攻

    博士課程,2016年07月,修了,

  • 京都大学  理学研究科  生物科学専攻

    修士課程,2012年03月,修了,

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(理学),ライフサイエンス / 生態学、環境学,京都大学,課程,2016年07月

  • 修士(理学),ライフサイエンス / 分子生物学,京都大学,課程,2012年03月

  • 学士(理学),ライフサイエンス / 分子生物学,神戸大学,課程,2010年03月

学内職歴 【 表示 / 非表示

  • 滋賀大学 データサイエンス・AIイノベーション研究推進センター,講師,2024年10月 ~ 継続中

  • 滋賀大学 データサイエンス・AIイノベーション研究推進センター,助教,2022年04月 ~ 2024年09月

  • 滋賀大学 データサイエンス教育研究センター,助教,2021年04月 ~ 2022年03月

学外略歴 【 表示 / 非表示

  • 京都大学 生態学研究センター,連携講師,2024年11月 ~ 継続中

  • 京都大学 生態学研究センター,助教,2022年07月 ~ 継続中

  • 京都大学 生態学研究センター,助教,2022年07月 ~ 継続中

  • 龍谷大学 教学部,非常勤講師,2020年04月 ~ 継続中

  • 京都大学 生態学研究センター,研究員,2017年04月 ~ 2021年03月

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所属学協会 【 表示 / 非表示

  • American Society of Plant Biologists,

  • 日本統計学会,

  • 日本バイオインフォマティクス学会,

  • 日本生態学会,

  • 日本植物生理学会,

研究分野 【 表示 / 非表示

  • ライフサイエンス / 植物分子、生理科学

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学

取得資格 【 表示 / 非表示

  • 日本バイオインフォマティクス学会認定技術者

  • 普通自動車免許(一種)

  • TOEIC公開テスト940点取得

 

論文 【 表示 / 非表示

  • Circadian and environmental signal integration in a natural population of <i>Arabidopsis</i>,Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,121巻 35号 ,2024年08月,Haruki Nishio, Dora L. Cano-Ramirez, Tomoaki Muranaka, Luíza Lane de Barros Dantas, Mie N. Honjo, Jiro Sugisaka, Hiroshi Kudoh, Antony N. Dodd

    DOI:10.1073/pnas.2402697121,研究論文(学術雑誌),共著

    担当区分:筆頭著者  

  • Statistical analysis of organelle movement using state-space models,Plant Methods,19巻 1号 (頁 67 ~ ) ,2023年07月,Haruki Nishio, Satoyuki Hirano, Yutaka Kodama

    DOI:10.1186/s13007-023-01038-6,研究論文(学術雑誌),共著

    担当区分:筆頭著者, 責任著者  

  • Duration of cold exposure defines the rate of reactivation of a perennial <i>FLC</i> orthologue via H3K27me3 accumulation,Scientific Reports,10巻 1号 (頁 16056 ~ ) ,2020年09月,Haruki Nishio, Koji Iwayama, Hiroshi Kudoh

    DOI:10.1038/s41598-020-72566-7,研究論文(学術雑誌),共著

    担当区分:筆頭著者, 責任著者  

  • Seasonal plasticity and diel stability of H3K27me3 in natural fluctuating environments,Nature Plants,6巻 9号 (頁 1091 ~ 1097) ,2020年08月,Haruki Nishio, Atsushi J. Nagano, Tasuku Ito, Yutaka Suzuki, Hiroshi Kudoh

    DOI:10.1038/s41477-020-00757-1,研究論文(学術雑誌),共著

    担当区分:筆頭著者, 責任著者  

  • Repressive chromatin modification underpins the long-term expression trend of a perennial flowering gene in nature,Nature Communications,11巻 1号 (頁 2065 ~ ) ,2020年05月,Haruki Nishio, Diana M. Buzas, Atsushi J. Nagano, Koji Iwayama, Masayuki Ushio, Hiroshi Kudoh

    DOI:10.1038/s41467-020-15896-4,研究論文(学術雑誌),共著

    担当区分:筆頭著者, 責任著者  

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著書 【 表示 / 非表示

  • エピジェネティクスの生態学,文一総合出版,,荒木希和子、西尾治幾 他

    学術書,分担執筆

総説・解説記事(速報、書評、報告書、記事他) 【 表示 / 非表示

  • 植物の季節応答、動物の胚発生、細胞のガン化に共通する仕組み,京都大学生態学研究センターニュース,147巻 (頁 12 ~ ) ,2021年01月,西尾治幾

    記事・総説・解説・論説等(大学・研究所紀要),単著

  • 植物が春を認識して開花期間を決める仕組み,生物工学会誌,98巻 10号 (頁 552 ~ ) ,2020年10月,西尾治幾

    記事・総説・解説・論説等(大学・研究所紀要),単著

  • in natura研究に魅せられて,京都大学生態学研究センターニュース,134巻 (頁 6 ~ ) ,2016年11月,西尾治幾

    記事・総説・解説・論説等(大学・研究所紀要),単著

  • Seasonal analysis of histone modifications at FLOWERING LOCUS C in a natural perennial population,Genes & Genetic Systems,2013年12月,Nishio H, Nagano AJ, Buzas DM, Kudoh H

    研究発表ペーパー・要旨(全国大会,その他学術会議),共著

講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • 第71回日本生態学会大会,国内会議,2024年03月,2024年03月,非生物的ストレスの記憶および花成制御における冬の記憶,口頭発表(一般)

  • The 33rd International Conference on Arabidopsis Research,国際会議,2023年06月,2023年06月,Seasonal dynamics of epigenome in a natural population of Arabidopsis halleri.,口頭発表(一般)

  • 第63回 日本植物生理学会年会,国内会議,2022年03月,不規則な環境変動下における花成抑制遺伝子FLCの頑健な制御,口頭発表(招待・特別)

  • 第69回 日本生態学会大会,国内会議,2022年03月,2022年03月,植物季節応答におけるエピジェネティック制御,口頭発表(招待・特別)

  • 第68回日本生態学会大会,国際会議,2021年03月,2021年03月,ヒストン修飾による季節的な遺伝子制御の進化,口頭発表(一般)

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受賞 【 表示 / 非表示

  • 第68回 日本生態学会 英語口頭発表聴衆特別賞,2021年03月,国内学会・会議・シンポジウム等の賞,,日本生態学会

  • GGS Prize 2017,2017年09月,学会誌・学術雑誌による顕彰,,日本遺伝学会

  • 第62回日本生態学会大会ポスター賞 優秀賞 ,2015年03月,国内学会・会議・シンポジウム等の賞,,日本生態学会

委員歴 【 表示 / 非表示

  • 日本生態学会,第71回日本生態学会大会(横浜) ポスター賞審査員,2024年03月

共同研究・競争的資金等の研究課題 【 表示 / 非表示

  • アブラナ科植物における季節的な遺伝子制御の種間比較,若手研究,2024年04月 ~ 2028年03月,日本学術振興会 科学研究費助成事業

  • BVOC放出とストレス耐性を連動させるエピゲノム分子基盤の解明,その他,学術変革領域研究(A),2023年04月 ~ 2028年03月,日本学術振興会 科学研究費助成事業

  • 時系列トランスクリプトームによる植物の適応進化の解析,その他,滋賀大学 研究スタートアップ助成事業,2023年04月 ~ 2024年03月

  • 車載カメラにおける周辺環境認識や自己位置推定に関する研究,共同研究,2022年04月 ~ 2025年03月,株式会社アイシン

  • SfMを用いた道路走行環境の三次元復元に関する研究,共同研究,一般受託研究,国内共同研究,2022年04月 ~ 2024年03月,トヨタ自動車株式会社

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共同研究希望テーマ 【 表示 / 非表示

  • 【キーワード】統計モデリング/時系列解析/バイオインフォマティクス/植物生態学/遺伝子発現

 

担当授業科目(学内) 【 表示 / 非表示

  • バイオインフォマティクス入門・実践(滋賀大学),2021年04月 ~ 2022年03月

 
 

社会貢献活動 【 表示 / 非表示

  • 福井県立藤島高等学校 データサイエンス講義,2023年07月

  • 福井県立藤島高等学校 データサイエンス講義・実習,2023年 ~ 継続中

  • ダイキン工業株式会社 データ分析道場,2023年 ~ 継続中

  • トヨタグループ機械学習実践道場,2021年05月 ~ 継続中

  • 福井県立高志高等学校 統計学研修,2021年 ~ 継続中

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