論文 - 江崎　剛史

1. A new workflow for the effective curation of membrane permeability data from open ADME information，Journal of Cheinformatics，16巻 （頁 30 ～ ） ，2024年03月，Esaki, T., Yonezawa, T. & Ikeda, K.

   DOI:https://doi.org/10.1186/s13321-024-00826-z，研究論文（学術雑誌），共著

   担当区分：筆頭著者,　責任著者  

   

2. Visualization of Substructure Contributing to Metabolic Stability using Morgan Fingerprint，CBI Journal，25巻 （頁 28 ～ 35） ，2025年05月，Tsuyoshi Esaki, Hirofumi Watanabe, Yugo Shimizu, Reiko Watanabe, Yuki Doi, Seisuke Takimoto, Kazuyoshi Ikeda

   DOI:10.1273/cbij.25.28，，共著

   担当区分：筆頭著者,　責任著者  

   

3. 添付文書から薬物動態特性を抽出する方法の検討：対話側AIシステムの活用，医薬品情報学，26巻 2号 （頁 80 ～ 91） ，2024年09月，江崎　剛史、小川　慶子、池田　和由

   研究論文（学術雑誌），共著

   担当区分：筆頭著者,　責任著者  

4. DruMAP: a Novel Drug Metabolism and Pharmacokinetics Analysis Platform，Journal of Medicinal Chemistry，66巻 14号 （頁 9697 ～ 9709） ，2023年07月，Hitoshi Kawashima, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Masataka Kuroda, Chioko Nagao, Yayoi Natsume-Kitatani, Rikiya Ohashi, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi

   ，共著

5. Difficulties and prospects of data curation for ADME in silico modeling，CBI Journal，23巻 （頁 1 ～ 6） ，2023年01月，Tsuyoshi Esaki, Kazuyoshi Ikeda

   ，共著

   担当区分：筆頭著者,　責任著者  

6. A large-scale targeted proteomics of plasma extracellular vesicles shows utility for prognosis prediction subtyping in colorectal cancer，Cancer Medicine，12巻 6号 （頁 7616 ～ 7626） ，2022年11月，Keiko Kasahara, Ryohei Narumi, Satoshi Nagayama, Keiko Masuda, Tsuyoshi Esaki, Kazutaka Obama, Takeshi Tomonaga, Yoshiharu Sakai, Yoshihiro Shimizu, Jun Adachi

   DOI:https://doi.org/10.1002/cam4.5442，研究論文（学術雑誌），共著

   

7. Prediction Models for Fraction of Absorption and Membrane Permeability using Mordred Descriptors，Chem-Bio Informatics Journal，22巻 （頁 46 ～ 54） ，2022年09月，Tsuyoshi Esaki, Tomoki Yonezawa, Daisuke Yamazaki, Kazuyoshi Ikeda

   研究論文（学術雑誌），共著

   担当区分：筆頭著者,　責任著者  

8. Benchmark of 3D conformer generation and molecular property calculation for medium-sized molecules ，Chem-Bio Informatics Journal，22巻 （頁 38 ～ 45） ，2022年09月，Tomoki Yonezawa, Tsuyoshi Esaki, Kazuyoshi Ikeda

   研究論文（学術雑誌），共著

9. Utilizing public and private sector data to build better machine learning models for the prediction of pharmacokinetic parameters，Drug Discovery Today，27巻 11号 （頁 103339 ～ ） ，2022年08月，Masataka Kuroda, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Hitoshi Kawashima, Rikiya Ohashi, Tomohiro Sato, Teruki Honma, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi

   研究論文（学術雑誌），共著

10. Metabolic dynamics during plant mitosis are revealed by tracking metabolites at single cell resolution，Plant Physiology，189巻 2号 （頁 459 ～ 464） ，2022年03月，Emiko Okubo-Kurihara, Ahmed Ali, Mika Hiramoto, Yukio Kurihara, Yasmine Abouleila, Eman Muhammad Abdelazem, Takayuki Kawai, Yuko Makita, Mika Kawashima, Tsuyoshi Esaki, Hiroaki Shimada, Tetsuya Mori, Masami Yokota Hirai, Takumi Higaki, Seiichiro Hasezawa, Yoshihiro Shimizu, Tsutomu Masujima and Minami Matsui

    DOI:10.1093/plphys/kiac093，研究論文（学術雑誌），共著

    

11. Development of an in silico Prediction Model for P-glycoprotein Efflux Potential in Brain Capillary Endothelial Cells Towards the Prediction of Brain Penetration，Journal of Medicinal Chemistry，64巻 5号 （頁 2725 ～ 2738） ，2021年02月，Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Rikiya Ohashi, Masataka Kuroda, Hitoshi Kawashima, Hiroshi Komura, Yayoi Natsume-Kitatani and Kenji Mizuguchi

    DOI:https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.0c02011，研究論文（学術雑誌），共著

    

12. Estimation of relationships between gene expression and chemical substructures: Adapting canonical correlation analysis for small sample data by gathered features using consensus clustering，CBI Journal，20巻 1号 （頁 58 ～ 61） ，2020年09月，Tsuyoshi Esaki, Takaaki Horinouchi, Yayoi Natsume-Kitatani, Yosui Nojima, Iwao Sakane, Hidetoshi Matsui

    研究論文（学術雑誌），共著

13. Open Innovation Platform using Cloud-based Applications and Collaborative Space: A Case Study of Solubility Prediction Model Development，Chem-Bio Informatics Journal，20巻 1号 （頁 5 ～ 18） ，2020年04月，Tsuyoshi Esaki, Keio Kumazawa, Kazutoshi Takahashi, Reiko Watanabe, Tomohide Masuda, Hirofumi Watanabe, Yugo Shimizu, Akitoshi Okada, Seisuke Takimoto, Shimada, Kazuyoshi Ikeda

    研究論文（学術雑誌），共著

14. Novel development of an anti-flavivirus drug targeting the nucleolar distribution of the core protein，Virology，541巻 （頁 41 ～ 51） ，2020年02月，Makoto Tokunaga, Yoichi Miyamoto, Tatsuya Suzuki, Mayumi Otani, Shinsuke Inuki, Tsuyoshi Esaki, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi, Hiroaki Ohno, Yoshihiro Yoneda, Toru Okamoto, Masahiro Oka, Yoshiharu Matsuura

    研究論文（学術雑誌），共著

15. Development of in silico prediction system of human renal excretion and clearance from chemical structure information，Scientific Reports，9巻 （頁 18782 ～ ） ，2019年12月，Reiko Watanabe, Rikiya Ohashi, Tsuyoshi Esaki, Hitoshi Kawashima, Yayoi Natsume-Kitatani, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

    研究論文（学術雑誌），共著

16. Constructing an in silico three-class predictor of human intestinal absorption with Caco-2 permeability and dried-DMSO solubility，Journal of Pharmaceutical Sciences，108巻 11号 （頁 3630 ～ 3639） ，2019年11月，Tsuyoshi Esaki, Rikiya Ohashi, Reiko Watanabe, Yayoi Natsume-Kitatani, Hitoshi Kawashima, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

    研究論文（学術雑誌），共著

17. Computational model to predict the fraction of unbound drug in the brain，Journal of Chemical Information and Modeling，59巻 7号 （頁 3251 ～ 3261） ，2019年07月，Tsuyoshi Esaki, Rikiya Ohashi, Reiko Watanabe, Yayoi Natsume-Kitatani, Hitoshi Kawashima, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

    研究論文（学術雑誌），共著

18. Development of a simplified in vitro P-glycoprotein substrate assay and in silico three-class classification model to evaluate transport potential of P-glycoprotein，Molecular Pharmaceutics，16巻 5号 （頁 1851 ～ 1863） ，2019年04月，Rikiya Ohashi, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Tomomi Taniguchi, Nao Torimoto-Katori, Tomoko Watanabe, Yuko Ogasawara, Tsuyoshi Takahashi, Mikiko Tsukimoto, Kenji Mizuguchi

    研究論文（学術雑誌），共著

19. Data curation can improve the prediction accuracy of metabolic intrinsic clearance，Molecular Informatics，38巻 1号 （頁 1800086 ～ ） ，2019年01月，Tsuyoshi Esaki, Reiko Watanabe, Hitoshi Kawashima, Yayoi Natsume-Kitatani, Chioko Nagao, Rikiya Ohashi, Kenji Mizuguchi

    研究論文（学術雑誌），共著

20. Predicting fraction unbound in human plasma from chemical structure: improved accuracy in the low value ranges，Molecular Pharmaceutics，15巻 11号 （頁 5302 ～ 5311） ，2018年11月，Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Hitoshi Kawashima, Yayoi Natsume-Kitatani, Chioko Nagao, Rikiya Ohashi, Kenji Mizuguchi

    研究論文（学術雑誌），共著